Një metodë inovative për të luftuar sëmundjet e të korrave duke përdorur baktere të dobishme lokale të tokës ka dalë nga bashkëpunimi midis shkencës dhe industrisë.
Një ekip shkencëtarësh nga Qendra John Innes (MB) izoloi dhe testoi qindra lloje të baktereve Pseudomonas nga toka e mbledhur nga zonat e fermave, dhe më pas renditi gjenomet e 69 prej tyre.
Duke krahasuar gjenomet e atyre shtameve që pengojnë aktivitetin patogjen me ato që nuk e bëjnë këtë, ekipi ishte në gjendje të identifikonte një mekanizëm kyç për mbrojtjen e të korrave të patates nga bakteret e dëmshme.
Më pas, duke përdorur një kombinim të kimisë dhe gjenetikës dhe një sërë eksperimentesh, shkencëtarët treguan se prodhimi i molekulave të vogla të quajtura lipopeptide ciklike është i rëndësishëm në kontrollin e zgjebes së patates (një sëmundje bakteriale që shkakton dëme të konsiderueshme në kulturën e patates). Këto molekula të vogla kanë një efekt antibakterial në bakteret patogjene që shkaktojnë zgjebe dhe ndihmojnë bakteret e dobishme Pseudomonas të migrojnë dhe të kolonizojnë rrënjët e bimëve.
Eksperimentet kanë treguar gjithashtu se ujitja shkakton ndryshime të rëndësishme në popullatën gjenetikisht të ndryshme të Pseudomonas në tokë.
Studimi, i publikuar në eLife, ofron një metodë me të cilën shkencëtarët mund të studiojnë mikrobiomën e pothuajse çdo zone të një fushe dhe të marrin parasysh kushte të ndryshme të tokës, agrokimike dhe mjedisore.
Duke përdorur përparimet në renditjen gjenetike me shpejtësi të lartë, shkencëtarët mund të testojnë mikrobiomën e tokës për baktere të dobishme dhe të përcaktojnë se cilat molekula prodhohen për të shtypur patogjenët. Hapi tjetër është përhapja dhe kthimi i mikroorganizmave të dobishëm në të njëjtën fushë.
Aplikimet e mundshme për përmirësuesit e mikrobiomit përfshijnë aplikimin e koktejeve bakteriale në sipërfaqen e zhardhokëve si një spërkatje ose direkt në tokë duke përdorur ujitje me pika.